No.1 虚无的支配者——杰姆那斯/ゼムナス/Xemnas
属性：无 | 武器：虚无之剑
十三机关的领导者。是贤者安塞姆(Ansem)的大弟子塞阿诺特(Xehanort)的无存，将老师的名字加上异端之证“X”之后作为自己的名字。在机关中，他的力量是绝对的，其强大程度令所有其他成员都为之震撼。平时的说话及动作都像演戏一样夸张，其实那是为了表现出感情而故意做出来的。不仅对心的研究非常关注，对“记忆”的研究也很关心。
No.2 魔弹的射手——西格巴尔/シグバール/Xigbar
属性：空间 | 武器：矢铳
十三机关初期成员之一。特征是独眼，并且脸上有一条很明显的伤疤，给人一种身经百战的感觉。他拥有自由穿越空间的能力，并且经常用变换自在的枪来玩弄自己的猎物。感觉很敏锐，不过与之相反的是他的性格却非常轻浮，会令别人无法分辨他到底是在说真话还是玩笑话。另外，他还经常会监视机关其他成员的活动。
No.3 旋风的六枪——札尔丁/ザルディン/Xaldin
属性：风 | 武器：长枪
十三机关初期成员之一，是一位刚直的猛者。他拥有操纵狂风的能力，并且在此基础上练成了使用六把长枪的六枪流。他不但战斗能力超强，口才也非常出色，能够用断定的口气一直追探到对方的心底，并将对方彻底扭曲过来。与外表表现出来的刚正不阿的武夫形象相反，其内心是充满恶意的。
No.4 冰冻的学士——维克森/ヴィクセン/Vexen
属性：冰 | 武器：巨盾
十三机关初期成员之一，拥有支配冰的力量。作为研究人员，他最大的乐趣就是用巨大的盾牌保护自己的同时收集对方的资料数据。对于有兴趣的问题就一定要亲自去确认下也是他的性格。对于机关内部的顺位问题很看重，经常会摆出前辈的架子对排名靠后的成员们用很不客气的口吻说话。
No.5 寂静的豪杰——雷克萨斯/レクセウス/Lexaeus
属性：土 | 武器：斧刃
十三机关初期成员之一，是一位操纵土的力量的巨汉，最擅长利用自己的巨大的身材发动强力的攻击。他有着很严肃的性格，平时很少说话，喜欢用行动而不是语言来表现自己的意志。虽然他有着强大的力量，但是做事却很沉着冷静，行动之前都会冷静地先观察事态的发展。
No.6 影之策士——泽克西昂/ゼクシオン/Zexion
属性：幻 | 武器：辞典
十三机关初期成员之一，言行举止都给人一种文质彬彬的感觉。拥有控制幻象的能力，甚至可以迷惑敌人自己灭亡。同时他也是一名头脑清晰的策略家，为了自己的策略能够成功甚至不惜利用自己的同伴。
No.7 月舞之魔人——塞克斯/サイクス/Saix
属性：月 | 武器：大剑
在机关中担任杰姆那斯的副官。能够吸收月亮的光辉从而爆发出惊人的力量，爆发后的战斗能力和凶暴程度都大幅提升。他是一个比较有代表性的无存，从他的身上看不到任何感情的表现，除了力量爆发之后的凶残性。比起其他的成员，他对心的研究更为关注，并且非常熟悉迷惑人心和伤害人心的方法。
No.8 炎之烈风——阿克塞尔/アクセル/Axel
属性：炎 | 武器：飞轮
有着像燃烧的火焰一样的红发。战斗中使用缠绕着火焰的飞轮来进行独特风格的攻击。比起机关的目的，他更多时候是以自己的心情来行动，在机关内部也经常被看作是很随便的人。他在机关中担任新人培养和处决背叛者的职位，所以跟新人洛克萨斯以及希恩关系非常好。虽然无存是没有心的，但是他却在三人共处的时间里找到了快乐的感觉。
No.9 小夜曲的旋律——德米克斯/デミックス/Demyx
属性：水 | 武器：锡塔尔琴
感觉不到紧张感，经常表现得像个小孩子一样的青年。能够使用一种叫做锡塔尔琴的乐器来控制水的力量做出自己的分身。平时也是非常懒散，总给人一种靠不住的感觉，即使是在任务中也不会认真去执行。不过，这些表现其实都只是表现出来的拟态而已，就是为了给他人留下一个不稳定的印象。
No.10 命运的赌徒——鲁克索德/ルクソード/Luxord
属性：时 | 武器：纸牌
有着金色的短发和整齐的胡子，给人一种绅士的感觉。不过他其实是一个连胜负都要靠赌的十足的赌徒。有着操控时间的能力，能够制作出特有的赌上性命的战斗舞台。面对任何情况都很镇静，并且会说出很从容的话来。头脑反应很快，对方稍微放松些就会落入他的陷阱。
No.11 优雅的凶刃——马鲁夏/マールーシャ/Marluxia
属性：花 | 武器：巨镰
挥舞着一把拥有花之力的巨大镰刀，忘却之城的负责人。虽然是机关的新人，不过其实力相当强劲，同时也有着很强的野心。平时的言行举止都充满了华丽的感觉，当然战斗技巧也是充分利用花之力进行优雅的攻击。
No.12 非情的妖姬——拉克西恩/ラクシーヌ/Larxene
属性：雷 | 武器：匕首
希恩加入之前机关里唯一的女性成员，与马尔夏一同负责忘却之城的管理工作。拥有控制雷电的力量，擅长用匕首高速接近敌人进行攻击。她的性格非常强势，甚至有些过度自信，从来都是以居高临下的态度对待别人，并且以伤害别人为乐趣。
No.13 邂逅之键——洛克萨斯/ロクサス/Roxas
属性：光 | 武器：键刃
索拉变成无心时产生的无存。由于他继承了索拉的能力，所以他能够使用键刃。但是索拉当时变成无心的时间很短，而且后来取回了自己的心并变回了人的形态，所以洛克萨斯是一个比较特殊的无存，没有和自己相对应的无心，同时也没有索拉的记忆。在加入机关之后，他被给与了各种各样的任务。在执行任务的过程中他开始想要找回自己的过去。
No.14——-希恩/シオン/Xion
属性：光 | 武器：键刃
十三机关中的第14位成员。与洛克萨斯一样有着使用键刃的能力。由于这个相同点，所以经常她与洛克萨斯交谈，同时很自然地得到了与洛克萨斯及阿克塞尔共同行动的机会。由于某次任务中的事件而开始对自身的存在抱有了疑问。